SRIM on Mac

SRIMをMacに移植。（Winebottlerを使います。）

かなり周りくどいやり方かもしれません。

まず、Winebottlerをダウンロード。（割りと重くて20~30分ほどかかった。）

この間に、SRIM-2008.exeをダウンロード（SRIM-2013は試していないです。）

SRIM-2008.exとしてダウンロードされるので、SRIM-2008.exeと名称変更する。

Winebottlerがダウンロード出来たら、Wine.app，Winebottler.appともにアプリケーションにコピー。

Wine を起動

メニューバーアイコンに表示されるので、クリックし File Maneger を選択。

すると、Wine Filesが作成される。（これを先に作成しないと、後でインストールした時にSRIM が Finder から見えないところに隠されてしまった。）

Winebottlerを開く。

Create Custom Prefixes から、先程落としたSRIM-2008.exeを選択し、Installボタンを押す。
次のような表示がされるので、適当な場所に展開Extractさせる。

展開させたファイルの中に、SETUP.EXE　があるはずなので、こちらをクリック。

ここで、先ほど作成したWine Files （ ~/Wine Files/drive_c/ 以下）にインストール。
今回は~/Wine Files/drive_c/Program Files/SRIM/にインストール。
実行形式は SR.exe。

Wine Files 以下に入るので、いちいち探しにいくのは面倒。
という事で、シンボリックリンク SRIM.app を作成。

suod ln -sf ~/Wine\ Files/drive_c/Program\ Files/SRIM/SR.exe /Application/SRIM.app

cernlib

cernlibのインストール

このサイトから

• cernlib-2005-intelmac-bin.tar
• cernlib-2005-intelmac-lib.tar
• cernlib-2005-intelmac-include.tar

をダウンロード。
適当な場所に展開。（/ 以下にダウンロード）

cd /
sudo mkdir cern
cd cern
sudo ln -sf /Users/rivertemple/cernlib/2005/ pro

.bashrcの作成

Mac のターミナルで ls 実行時に色をつけるように設定。

オプションで -G とつければ良いみたいです。
ただ、いちいち打つのは面倒なので、.bashrc を以下の内容で作成しました。

alias ls='ls -Fh -G'

alias ll='ls -la -G'

また、-Fh (ファイル種類の区別とサイズを区別) オプションも付けました。

編集し終えたら

source .bashrc 

とすると、編集内容が反映されます。

.bashrc を読みこませるように、.bash_profileに以下の文を追加。


if [ -f ~/.bashrc ]; then
    . ~/.bashrc
fi

こちらの記事を参考にしました。ありがとうございます。

ついでに、プレビューとかもターミナルで開けるように以下の文も追加しました。

alias prev='open -a preview' 

Topdrawer インストール

Topdrawer を MacOSX10.8にインストール。

topdrawer では UGS (Unified Graphics System) ver.2.10e をライブラリ
として使用しているので、UGSをインストールしていない場合は先にインストールする。
UGSのインストールに関しては、以前の記事を参照。

ftp://ftp.riken.jp/iris/topdrawer/topdrawer.tar.gz
からtopdrawer.tar.gz をダウンロード、展開。

ディレクトリ topdrawer に移動し、Imakefile.def を編集。

• #define DarwinArchitecture を選択。
• ugsのパスを変更。
• FFLAGS、CFLAGS に -m32 を追加。

その後次のコマンドを実行。
xmkmf -a
make clean
make all

td 実行形式が作成されるので、/usr/lib/にシンボリックリンクを作成。

teleport

magic mouse を Mac miniとMacbook Air とで同時に使いたい。
と思ったら、「teleport」という便利なアプリがあったので導入してみます。

http://www.abyssoft.com/software/teleport/
にて teleport1.1.2a を双方のMacにダウンロード。
releport.prefPaneを選択すると、設定画面が開く。
どちらとも Active teleport の選択にチェックを入れる。

今回はMac mini を母体として magic mouse を通常使うので、Mac book air の方でShare this Mac の選択にテェックを入れます。

すると、母体のMac miniに承認ウィンドウが表示されるのでOKとし、設定完了。
これで、画面端にマウスを持って行くと、他方のMacに移動ができます。

操作感は少しもたつく感じがありますが、便利に使えそう。

また Optionsで Mac間の移動の詳細設定が出来るみたいです。

fort77のインストール

研究室のMac-miniには入っていましたが、自分のMacbook Air には入っていなかったので、インストールしてみる。

以下のところからtar.gzを落とす。
http://fossies.org/linux/misc/old/fort77-1.18.tar.gz/

MountainLionは64bitなので、-c では頑に64bitでのリンク付けをする。
今回は解析ツールPollyAnna(32bitで構成)との互換性のため少し修正を加える必要がある。
適当な場所に /fort77-1.18 を展開
リンク付けする際に-m32オプションをつける。
emacs fort77
$retcode = &mysystem($cc, @output, @lfiles, @lopts, "-m32", "-lf2c", "-lm" );

基本的にはこれで終了。
make testするとエラーがでるので test/test.pl も書き換える。
./fort77 → ./fort77 -m32

PollyAnnaのインストール

MountainLion (OS X 10.8) にPollyAnnaをインストール

sudo port -f uninstall installed
sudo rm -rf /opt
MacPorts-2.1.2-10.8-MountainLion.pkg をインストール
/opt/local/etc/macports/macports.confを編集 → build_arch i386を有効
sudo port install ptex +utf8 +no_x11 build_arch=x86_64
sudo port install tcl +universal +x11
sudo port install tk +universal +x11
=== XQuartz導入 ===

sudo port -f install xorg-server-devel +universal → error!
ライセンス認証が必要みたい。

Error: org.macports.build for port bootstrap_cmds returned: command execution failed

Error: Failed to install bootstrap_cmds

Please see the log file for port bootstrap_cmds for details:

sudo xcodebuild -license → agree
sudo port -f install xorg-server-devel +universal → 成功


X11関連のライブラリのリンク付けする。
sudo ln -sf /opt/local/include/X11 /usr/include/X11　


sudo port install gsed +universal
sudo port install g95
sudo port install imake +universal
=== f2c導入 ===
buildf2cを編集して、-m32を付加
sudo ./buildf2c
=== ugs ===
tar -xvf ugs.tar
cd ugs
emacs Imakefile.def

1. #define DarwinArchitectureを選択
2. FFLAGS,CFLAGSに -m32 を付加
3. CFLAGS = -O0 -m32 （※-O2はダメ）

emacs src/Imakefile

1. fort77 -m32に変更

xmkmf
make Makefiles
make clean
make all
./test/tryxw → O.K.
=== handypak ===
tar -xvf handypak.tar
cd handypak
emacs Imakefile.def

1. #define DarwinArchitectureを選択
2. SHAREDをコメントアウト
3. -m32 を付加

xmkmf
make Makefiles
make clean
make all
=== polly ===
tar -xvf polly.tar
cd polly
cd tcl-src/
make
cd ../src
emacs Imakefile.def

1. #define DarwinArchitectureを選択
2. SHAREDをコメントアウト
3. HPK,SHM,UGSのパスを変更
4. -m32を付加

xmkmf
make clean
make all
cd ..
emacs polly 以下を追加
--- ここから ---
if {$tk_version >= 8.4} {
       tk::unsupported::ExposePrivateCommand tkListboxBeginSelect
       tk::unsupported::ExposePrivateCommand tkListboxUpDown
       tk::unsupported::ExposePrivateCommand tkListboxExtendUpDown
}
--- ここまで ---
init.tclを編集して、プリンタ部分に以下を追加
   Darwin {set LPSTATUS "lpc status"}
=== anna ===
tar -xvf anna.tar
cd anna
cd src
cd Defs
ファイル Darwin を以下の内容で用意

• ARCH = __DARWIN
• FC = g95
• FFLAGS = -O2 -fstatic -D$(ARCH) -DHCOM_SIZE=$(NHCOM) -m32
• CFLAGS = -O2 -D$(ARCH) -m32

cd ../main
emacs main.F

1. if defined(__AIX) を if defined(__AIX) || defined(__DARWIN)に変更

cd ..
emacs configure

1. handypak にパスを通す

emacs Makefile.in

1. $(TOOLS) を外す

./configure
make clean
make all
=== mars2.4 ===
tar -xvf ../Downloads/mars2.4-offline.tar
tar -xvf ../Downloads/mars2.4-docs.tar
cd mars2.4/
./configure -offline
emacs Makefile.in

1. SAMPLER = /bin/dd bs=65536 if=%s

cd src
emacs Makefile

1. TARGET2 を libanalyzerのみ
2. CFLAGSに -m32 を付加

cd analyzer
emacs Makefile

1. CFLAGSに-m32を付加

emacs analyzer.c

1. sampler 周り（rexec関連）を削除
2. L117に;を追加　

cd ../../example
emacs Makefile

1. FFLAGSとCFLAGSに-m32を付加

cd ..
make clean
make all
=== aspell ===
sudo port install aspell +universal
sudo port install aspell-dict-en